网站文件在服务器上的位置根据不同的服务器环境和配置有所不同。一般来说，主流的服务器操作系统包括Windows Server和Linux，以下将分别讨论它们的文件存放位置。

在Windows Server上，网站文件通常存放在Internet Information Services (IIS)的网站根目录中。默认情况下，IIS的网站根目录位于C盘的inetpub文件夹下，路径为C:\inetpub\wwwroot。这是一个公共目录，用于存放多个网站的文件。每个网站通常会被分配一个子文件夹来存放其文件。例如，如果有一个名为"example.com"的网站，其文件可以存放在C:\inetpub\wwwroot\example.com文件夹中。

对于Linux服务器，网站文件通常存放在Apache或Nginx的默认网站目录中。在Apache上，默认的网站根目录位于"/var/www/html"，而在Nginx上，默认的网站根目录位于"/usr/share/nginx/html"。类似于Windows Server，每个网站通常会被放在一个子目录中进行管理。

无论是Windows Server还是Linux服务器，网站文件夹通常会包含一些固定的文件和目录，例如HTML、CSS、JavaScript等前端文件，还有后端脚本文件，如PHP、Python、Ruby等。此外，还可能包含一些上传的文件、图片和其它资源文件。

需要注意的是，网站的文件存放位置可以根据需要进行修改。管理员可以根据实际情况调整网站根目录的位置，以便更好的管理和组织网站文件。